La protection automatique contre les courts-circuits est une fonctionnalité présente sur tous les programmateurs Hunter fonctionnant sur secteur. Elle détecte automatiquement les défaillances électriques généralement dues à des problèmes de câblage. Les stations présentant des courts-circuits sont ignorées, ce qui permet de poursuivre l'arrosage pour les stations non défectueuses. Il n'existe aucun risque de fusible grillé ou de déclenchement de disjoncteurs internes pouvant occasionner une désactivation complète de l'arrosage.